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王文奎主任率先提出中医“五脏阴阳”辨证纲领和“三维守恒”法则，倡导“以调为本，以平为期”治疗新理念，主张“七学归宗，七派统一”中医新思路。探索中医的生理观、病理观，认识到生命运动的根本在于五脏功能的运动，明确了医学的目的不是简单地为病而治，更要解决好疾病、健康和死亡问题，要保障人类的健康和生命的延续。
目前，王文奎先生已完成研究成果三十多项，撰写论文四十余篇,发表在《中国工程科学》、《前沿科学》、《科学中国人》、《中国中医药报》、《光明日报》等刊物，并对现代社会之养生术有独到的见解，其学术观点和理论思想曾得到原国家第一任中医司司长、中医泰斗吕炳奎先生，著名肝病专家关幼波先生，陈式太极传人吉良晨教授，有“南邓”之称的广东中医药大学终身教授邓铁涛等老前辈们的高度赞誉和医界同仁们的普遍赏识。对常见病、疑难病的治疗效果更是得到社会各界广泛好评。
在2003年“非典”期间，王文奎主任是唯一一位被点名直接进入北京抗非典一线的传统中医。“非典”之后，王文奎主任被科技部委派，负责承担“中医药防治艾滋病”课题的调研，并参加“国家中医药发展战略研究”课题研究，使“国家中医药发展战略研究”2004年以后研究重点转移到“中医药防治艾滋病”的当务之急上来。其间，免费治疗艾滋病患者九十余人，疗效突出。
2005年8月，经过严格筛选和多方论证，王文奎主任被推选为国家重点基础研究发展计划（973计划）“中医五脏理论创新性及中医治疗艾滋病的研究”课题负责人，由他所在的北京泰一和中医药研究所承担该课题的科研任务，这也是中国民间研究机构首次承担国家重大科研课题。1963年，王文奎先生即将就任县长之际，年逾八旬的曾祖父以绝食的方式严命他辞官还乡，专习医业，以续祖脉。此后，便不问世事，一头钻进医道之中。
1968年，小儿腹泻、痢疾、急性肠胃炎流行，王文奎根据家传方药独创“止泻散”、“止呕散”，6小时即可止泻，急性肠胃炎2-3小时即可治愈。
1975年，王文奎将《内经》医理融会家传医术和历史上七派医家的思想，提出以“五脏阴阳辨治纲领”为核心的万病归宗理论，开始绘制《万病归宗图》。
1987年，在家传方药的基础上，完善了五脏辨治的药物体系，治疗肿瘤、心脑血管病、糖尿病、肝胆胰腺、老慢支、妇科男科顽症等疑难杂症，屡见奇效。
1988年，王文奎在北京某部队医院出专家门诊，不到3个月便门庭若市。
1996年，王文奎创立针对重大疾病的研究机构“北京泰一和中医药研究所”，任研究所主任。
2003年，经国务院批准，国家中医药管理局首任局长、中医泰斗吕炳奎亲自点将，王文奎成为进入北京抗“非典”前线的中医第一人。
2004年，受国家科技部委托，王文奎代表国家“中医药发展战略研究课题组”深入艾滋病重灾区进行免费诊治，受到政府和百姓的一致好评。
2005年，担任国家重大基础研究发展计划（973计划）中医五脏理论研究首席科学家（编号：2005CB523506）。
2006-2008年，王文奎在《前沿科学》、《中国工程科学》、《中国医药导报》、《中华中医药学刊》等国家权威学术期刊发表973课题五脏理论及方药研究成果，国家科技部副部长程津培院士亲自推荐。
2008年，成立北京三生万医药科技有限公司，王文奎将五脏方制成现代剂型，泰和堂家藏至宝公之于世。
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